基于InDel標(biāo)記的黃瓜種質(zhì)資源遺傳多樣性分析

        | 摘要 | 為明確黃瓜自交系間的親緣關(guān)系，篩選適宜作雜交親本的種質(zhì)資源，利用InDel標(biāo)記對48份黃瓜自交系進(jìn)行遺傳多樣性分析。

        NTSYS2.1軟件聚類的結(jié)果表明，在相似性系數(shù)為0.44時，48份材料被劃分為2大類群，主要為密刺黃瓜和水果黃瓜，用Power Marker 3.25軟件進(jìn)行樹狀圖分析，結(jié)果與NTYSYS聚類結(jié)果一致。研究結(jié)果為了解黃瓜種質(zhì)資源遺傳背景及親本組合的選配奠定基礎(chǔ)。

圖1. 標(biāo)記InDel250對48份黃瓜種質(zhì)資源的電泳圖

        從本實(shí)驗(yàn)室前期開發(fā)出的10470個InDel標(biāo)記中初步選擇68對InDel標(biāo)記對48份黃瓜自交系進(jìn)行分析，結(jié)果表明39對InDel標(biāo)記具有強(qiáng)多態(tài)性。圖1為標(biāo)記InDel250對48份黃瓜種質(zhì)材料擴(kuò)增出兩個等位基因的電泳圖。

圖2. 48份黃瓜資源聚類分析

采用NTSYS 2.1軟件中的UPGMA對48份黃瓜種質(zhì)資源進(jìn)行聚類分析作圖，結(jié)果見圖2．在相似系數(shù)為0.44時，將黃瓜種質(zhì)劃分為2個類群，第1類群包括D1、D2、D3、D12、D5等31份材料，且大部分密刺黃瓜被聚為此類；第2類群包括X1、X3、X7、X4、X11等17份材料，且該類群76.5%為水果黃瓜；白綠黑刺黃瓜、白綠稀刺黃瓜全部在第1大類群，2份白綠無刺黃瓜在第2大類群。

  為了驗(yàn)證NTYSYS軟件的分析結(jié)果，用Power Marker3.25軟件進(jìn)行了聚類分析，發(fā)現(xiàn)48份黃瓜自交系也是被聚為2大類群（圖3），且聚類結(jié)果與上述NTSYS軟件分析結(jié)果完全一致。

圖3. 48份黃瓜資源聚類樹狀圖